一个天麻可长出50个左右蒴果，每个蒴果中约有3～5万粒种子，可见天麻种子十分微小，肉眼很难看清。借助显微镜和扫描电子显微镜可以看到，成熟天麻种子一般呈纺锤形或新月形，长约0.8～1.0微米，宽约0.16～0.2微米；种子由种胚和种皮两部分组成；种皮是由一层无色透明的薄壁死细胞组成的薄膜，细胞大，略呈长方形，在透射光下像网状，种皮内除种胚之外无其它贮存物质。种胚长约0.2毫米，宽约0.12毫米，位于种子中部；成熟胚呈黄色，倒卵形，基部有一喙状突起；种胚由数十个（30～60个）细胞组成，没有器官分化，但有组织分化；种胚组织依照细胞大小及功能可区分为上下两个部分，上部为密集的小细胞组成的分生组织，约占全胚体积的1/5，组成分生组织的细胞具有较强的分生能力，称为分生细胞，种胚萌发过程中细胞数目的增多就是靠这部分细胞不断地分裂；下部为特大细胞组成的感菌组织，约占全胚体积的4/5，组成感菌组织的细胞分裂十分缓慢，其中基部与胚柄直接接触的一个细胞呈倒三角形，突出在卵形胚的末端，称其为胚柄细胞。胚柄细胞为胚的吸器，种胚就是靠胚柄细胞固着在种皮的内表面的，它在胚的发育前期和中期十分发达，但在授粉13天以后逐渐退化，成熟胚已无胚柄结构，仅有一残迹间或可见。

一个天麻可长出50个左右蒴果，每个蒴果中约有3～5万粒种子，可见天麻种子十分微小，肉眼很难看清。借助显微镜和扫描电子显微镜可以看到，成熟天麻种子一般呈纺锤形或新月形，长约0.8～1.0微米，宽约0.16～0.2微米；种子由种胚和种皮两部分组成；种皮是由一层无色透明的薄壁死细胞组成的薄膜，细胞大，略呈长方形，在透射光下像网状，种皮内除种胚之外无其它贮存物质。种胚长约0.2毫米，宽约0.12毫米，位于种子中部；成熟胚呈黄色，倒卵形，基部有一喙状突起；种胚由数十个（30～60个）细胞组成，没有器官分化，但有组织分化；种胚组织依照细胞大小及功能可区分为上下两个部分，上部为密集的小细胞组成的分生组织，约占全胚体积的1/5，组成分生组织的细胞具有较强的分生能力，称为分生细胞，种胚萌发过程中细胞数目的增多就是靠这部分细胞不断地分裂；下部为特大细胞组成的感菌组织，约占全胚体积的4/5，组成感菌组织的细胞分裂十分缓慢，其中基部与胚柄直接接触的一个细胞呈倒三角形，突出在卵形胚的末端，称其为胚柄细胞。胚柄细胞为胚的吸器，种胚就是靠胚柄细胞固着在种皮的内表面的，它在胚的发育前期和中期十分发达，但在授粉13天以后逐渐退化，成熟胚已无胚柄结构，仅有一残迹间或可见。