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福建省农业科学院成立于1960年，是福建省最高的农牧业综合科研机构。现设有水稻、果树、畜牧兽医、植物保护、土壤肥料、甘蔗、茶叶、作物、农业工程技术、农业经济与科技信息、农业生态、生物技术、农业生物资源等研究所和中心实验室、蘑菇菌种研究推广站等15个研究单位和1个科技干部培训中心。目前已建有福州国家水稻改良分中心、国家龙眼枇杷资源圃、国家红萍品种资源圃，2个省级重点实验室、8个省级工程技术研究中心，有130多公顷实验场、圃，保存珍贵作物种质资源13000多份。
在职职工1080人，其中：高级专业技术人员313人，中级专业技术人员283人；有中国科学院院士1人、国家级专家5人、省级专家14人、享受国务院特殊津贴76人；有博士（含在读）81人、硕士179（含在读）人；有35位科技人员进入国家、省“百千万人才工程”人选。人事部在我院设立了博士后工作站和引智基地；2005年中国农业科学院研究生院与福建省农业科学院联合创办研究生教学实习基地。1978年—2006年，共取得国家、部省级科技奖励成果319项，其中省部级二等奖以上重大成果74项。
福建省农业科学院坚持以应用研究和开发研究为主，适当开展基础研究，着力提高科技创新能力，在作物育种、动物疫病防治、畜禽饲料、生物农药、植物保护、食（药）用菌、农业生态、台湾农业等研究具有较强科技力量。在超级稻育种、水稻转基育种、枇杷龙眼杂交育种、畜禽疫苗、生物农药、害虫天敌捕食螨生防技术、欧鳗小瓜虫血清型研究、鸭出血症病原学研究、柑桔黄龙病研究、红萍研究等方面研究居世界先进水平。
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