目前我国水果、蔬菜化肥用量普遍高于西方发达国家，其中果树亩均化肥用量是日本的 2倍多、美国的 6倍、欧盟的 7倍，水果、蔬菜、茶叶等园艺作物化肥用量占比达到了总用量的40%。

　　有机肥腐熟时间较长，翻堆、干燥、粉碎、包装等操作过程人工投入量大，导致有机肥生产成本增加；并且目前有机肥还不能享受化肥的有关运输优惠政策，加上有机肥的使用量巨大，其运输成本通常为化学肥料的2～3倍。有机肥（畜禽粪）生产的人工成本和运输成本都比较高，造成果园种植成本的增加。

　　虽然施用有机肥，可使果蔬外观和内在品质明显提高，但消费者对于国内水果品质存在相对不信任，由成本增加导致的销售价格上涨在短时间内不能会被消费者接受，因此有机肥代替化肥的推广将面临诸多难点和困难。