短期保存种蛋对孵化率的影响不大，但保存期延长就会导致孵化率不断下降。保存种蛋的温度太低，相对湿度不足，通风不良，翻蛋不当，都影响孵化率。种蛋受冻、受振以及消毒不严，均可造成胚胎早期死亡增多，胚胎发育受阻，孵化率降低。
2、种蛋的品质
裂缝、污秽、畸形、太大、太小的蛋孵化效果不佳。
3、未受精蛋 在鸡群配种时遗漏配种的鸡蛋进行孵化，或者配种不成熟的，都可以影响到孵化率。
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