水稻施肥坚持分期施肥，严格控制氮肥，适当施用磷钾肥，补施锌肥的原则。根据不同品种的特点灵活掌握氮肥的施用量和不同时期的施肥量。一般特殊的优质米品种，如秋田小町、稻花香二号等，总氮量控制在每公顷220～240斤，一般优质米品种的总氮量控制在每公顷270～300斤，以高产为目的的其他品种的总氮量控制在每公顷300～350斤。每公顷磷肥90～100斤（五氧化二磷）和钾肥100斤（氧化钾）以及硫酸锌40-60斤就基本满足水稻生长所需。
底肥：增施有机肥，特别老稻田施用增产效果更加明显。根据有机肥质量确定施用量，公顷施腐熟有机肥10～30立方，翻地前扬匀。包括总施肥量中40%的氮肥、100%的磷肥、锌肥和50%的钾肥，一般耙地前施用。
分蘖肥：钵育苗机插不施返青肥，分蘖肥视情况施用。秧苗素质弱，水凉和地凉分蘖慢的地块，可以使用分蘖肥，用量控制在总氮肥量的20%以内。除此之外不应该施用分蘖肥。
调节肥：施用分蘖肥的稻田不施用调节肥。调节肥的施用方法也要看水稻分蘖情况，9×6寸插秧密度条件下，6月10日左右，每穴茎数少于10株就在6月15日前追施；每穴茎数13株左右就在6月20日前追施；每穴茎数多于13株就在6月25日前追施。调节肥用量控制在总氮肥量的20%以内。
穗肥：穗肥的作用主要在于防止分蘖退化，保证有效穗数，促进穗子的增长和粒的增加，是水稻一生中最主要的肥料，不仅要施而且要足。穗肥一般要根据施调节肥的时间及6月30日的分蘖数来决定。稻苗在6月30日每穴茎数20株以下，就马上追；20～25株就7月5日追；25～30株就7月10日追，超过30株就不追。施穗肥还要看前次追施调节肥的时间，一般需要间隔15天。穗肥用量为总氮量的30%，加钾肥的50%。
粒肥：在出穗前后，叶片颜色淡黄，气温相对高时追施，不然不用。粒肥用量控制在总氮量10%以内，以免贪青晚熟。