7月14日至18日，以市政府副市长林丽娇为组长，市卫生局、监察局、财政局和审计局等部门联合组成的督查组，对全市9个县（市、区）2008年以来农村合作医疗工作进行督查。

从督查情况看，各地均能做到以下几个方面：一是加强领导，落实责任。二是加强宣传，提高参合率。三是加强配套，提高补助标准。四是完善制度，提高补偿水平。五是加强监管、确保基金安全。六是加强培训，规范财务管理。七是信息化建设工作进展顺利。同时也存在部分问题，如：基层干部不够重视，宣传力度不够；县财政配套资金落实比较困难；管理机构力量薄弱，工作经费缺乏等。

针对检查出来的问题和上级的要求，督查组要求各地下一步要做好以下几个方面的工作：一是及早做好2009年度宣传发动工作。二是确保2008年财政补助资金足额到位。三是完善工作机制，确保基金运作规范。四是完善即时补偿和门诊补偿制度，加强定点医疗机构管理。五是今年完成新农合信息化建设。六是加强新农合经办机构能力建设。