四川省中医药管理局成立了局深化医药卫生体制改革领导小组。局医改工作组结合在医改工作中如何充分发挥中医药的优势作用，进行了大量的政策调研工作，起草形成了《在新医改中充分发挥中医药作用的政策建议研究报告》。四川省委、省人民政府出台《关于深化医药卫生体制改革的实施意见》，要求建立规范合理的公立医院政府投入机制，对中医院、民族医院等在投入政策上予以倾斜。在建立健全药品供应保障体系方面，强调鼓励使用中药饮片和民族医药，充分发挥中医药和民族医药“简、便、廉、验”的优势和作用。四川省人民政府印发的《四川省深化医药卫生体制改革近期工作方案（2009~2011年）》，要求将符合条件的中医诊疗项目、中药品种和医疗机构中药制剂纳入报销范围；基本药物全部纳入基本医疗保险药品目录，鼓励中医药服务的提供和使用，基本药物报销比例明显高于非基本药物。