我国饲料卫生标准规定，棉籽饼粕中游离棉酚允许量为≤0.12%。对于游离棉酚含量超过0.2%的棉籽（仁）饼粕，尤其是土榨棉籽饼，应当进行去毒处理，才能保证饲用安全。一般采用的方法有：　　(1) 硫酸亚铁法水溶液浸泡法　棉酚的毒性作用主要表现在它的活性羟基和醛基，因此如果能使这些基团失活，则可使其解毒。Fe2+、Ca2+、碱、氨、尿素等均具有去毒作用，常用硫酸亚铁中的亚铁离子（Fe2+）与游离棉酚螯合，使棉酚中的活性醛基和羟基失去作用，形成的棉酚-铁复合物在动物消化道内难以吸收。亚铁离子不仅能使其毒性降低，而且能降低其在肝脏中的蓄积量，从而起到预防中毒的作用。 　　去毒时根据棉籽（仁）饼粕中游离棉酚的含量，按铁元素与游离棉酚1：1的重量比，向饼粕中加入硫酸亚铁。由于通常所用的硫酸亚铁分子中含有结晶水（FeSO4·7H2O），其中铁元素只占硫酸亚铁分子量的1/5，因此，实际上硫酸亚铁的用量应按游离棉酚量的5倍计算。具体做法是将1．25 kg工业用硫酸亚铁，溶于125kg水中，浸泡50 kg粉碎的饼粕，中间搅拌几次，一昼夜后即可使用。这种去毒方法可在油脂厂棉籽加工过程中、饲料厂或饲养场进行。　　(2) 碱处理法　在饼粕中加入烧碱或纯碱的水溶液、石灰乳等。去毒可在榨油厂集中进行，即在饼粕中加碱，并加热蒸炒，使饼粕中游离棉酚被破坏或成为结合态。这种方法去毒效果较好，但由于碱处理后还要加酸进行中和，且要加热烘干，故较费工，成本也较高。去毒也可在饲养场进行。　　(3) 加热处理法　将棉籽（仁）饼粕经过蒸、煮、炒等加热处理，使游离棉酚与蛋白质和氨基酸结合而去毒。蒸煮法是将棉籽饼粉加适量水蒸煮并搅拌，保持沸腾0．5 h，冷却后饲用。此法宜在农村和饲养场采用，缺点是会使饼粕中赖氨酸的有效性大大降低。　　(4) 微生物发酵法　利用微生物发酵脱毒，使脱毒率达到78%-85%以上，且发酵过程产生菌体蛋白和维生素，提高了棉籽饼粕的营养价值。　　(5)液体旋风分离法　在棉籽未榨油前，将含有棉酚的色素腺体用物理方法除去的一种方法。其具体做法是先将棉仁粉碎至细度接近色腺体的大小(30μm)，然后用适当溶剂(如己烷)利用密度的不同在液体旋风分离器中把色腺体完全与蛋白质、油脂等物质分离而达到除去棉酚的目的。从20世纪六七十年代以来，美国就开始研究本法。目前由于一系列的技术问题没有解决，我国还没有使用。　　培育无腺体棉花新品种　　棉籽中的色素腺体是棉酚存在的主要场所，所以培育和种植无腺体棉花品种，是从根本上解决问题的途径。　　国外从20世纪50年代以来，已经育成一些无腺体棉花品种。从70年代起，中国引进了国外无腺体棉花品种，开始了我国无腺体棉的育种工作，育出了适合我国自然条件的无腺体棉花品种。　　无腺体棉仁中平均棉酚含量为0.02%，其粗蛋白质的含量可达45%，比有腺体的棉仁或大豆饼的含量都高。　　无腺体棉粕的氨基酸利用率与大豆饼相似，明显优于有腺体棉仁粕。