2006年，我市长武、旬邑、武功、淳化被省委省政府确定为新型农村合作医疗扩大试点县，加上2003年被确定的彬县，新型农村合作医疗制度已覆盖我市五县123.68万农民，截至2006年3月28 日，全市参加合作医疗农民数为105.06万人，参合率85.9%。试点工作开展以来，在市委、市政府的高度重视和大力支持下，各试点县坚持以人为本、可持续的科学发展观，认真做好基线调查、科学制定实施方案、全力以赴进行宣传、建立健全规章制度，有效监管合疗资金，保证了这项工作的顺利进行。
2006年1月1日起全面实行报销直通车制度，为参合患者开始补助，据统计，一季度全市获得补偿农民人数40443人，补偿资金555.6万元,其中住院人数8479人，报销394.4万元,门诊人数31732人,补助资金161.2万元。根据省政府关于新型农村合作医疗试点工作会议精神和市委、市政府的要求，2006年我市新型农村合作医疗要达到“三升两降”的目标：即参合率逐步提高，合作基金使用率逐步提高，受益面逐步提高；门诊、住院费用逐步下降，因病致贫的人数逐年减少。在基金不透支的前提下，合理调整起付线、封顶线和报销比例，基金的使用率不低于85％，同时积极推行“住院单病种定额付费”和“报销直通车”管理模式，以方便农民就诊、合理设定技术服务档次为前提，不分机构属性确定新型农村合作医疗定点医疗机构，降低患者的医疗费用负担，让人民群众真正得到实惠。
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