2006年广州全市参加农村合作医疗的人口覆盖率为86.17%，其中：白云区为81.87%、花都区为86.51%、番禺区为93.22%、南沙区86.87%，萝岗区69.14%，从化市为83.94%、增城市为85.28%。合作医疗的筹资水平每人每年为：番禺区和南沙区120元，花都区70元，白云区、萝岗区和增城市65元，从化市55元。2006年度全市农村合作医疗基金筹资总额为18850.99万元，其中各级财政投入的合作医疗补助资金12268.05万元，个人和村集体缴纳6582.94万元；保障救助基金筹资482.87万元。

2006年上半年全市参合农民住院补偿人数为44234人次，占参合农民的2.14﹪。上半年住院补偿总费用支出6327.95万元，占住院总费用的29.40%（即实际补偿比例）；人均住院费为4865元，人均住院补偿1431元。337人次获得合作医疗保障救助基金的住院医疗救助，救助金额为104.40万元。